在重设置文件权限时，请先关闭数据库服务器。

用以下命令把MySQL安装程序目录的属主和所属组设置为MySQL管理员帐号的用户名和用户组名。

% chown -R mysql.mysql /usr/local/mysql

另外一种方法是把除数据目录外的所有目录属主设置为root所有，如：

% chown -R root.mysql /usr/local/mysql
% chown -R mysql.mysql /usr/local/mysql/data

设置安装目录及各有关子目录的权限，允许管理员进行所有操作，只允许其他人进行读和执行访问，设置命令如下：

#设置mysql目录
% chmod 755 /usr/local/mysql
or
% chmod u=rwx,go=rx /usr/local/mysql
#设置mysql/bin目录
% chmod 755 /usr/local/mysql/bin
or
% chmod u=rwx,go=rx /usr/local/mysql/bin
#设置mysql/libexec目录
% chmod 700 /usr/local/mysql/libexec
or
% chmod u=rwx,go-rwx /usr/local/mysql/libexec

把数据目录及目录中的所有子目录和文件设置为只允许MySQL管理员访问。

% chmod -R go-rwx /usr/local/mysql/data

如果数据目录下有选项文件或套接字文件，并一些客户需访问这些文件，则可用以下的权限设置，使客户在没有读权限的前提下使用这些文件：

% chmod go+x /usr/local/mysql/data

mysql.sock套接字文件一般放以/tmp目录下，要确保该目录设置了粘着位，使自户只能删除自已创建的文件，不能删除其他用户创建的文件。/etc/my.cnf中公共选项文件，是对所有用户可读的，所以不应把一些敏感信息保存在里面。.my.cnf是用户专用选项文件，要确保只有该用户有权访问。

这样设置以后，只有MySQL管理员才能启动服务器。